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Le diagnostic génétique par séquençage

Méthodes utilisées par le Laboratoire SESEP pour le diagnostic de l'Hypophosphatasie

  • Séquençage des 12 exons du gène ALPL codant pour la phosphatase alcaline non tissu-spécifique (sur le chromosme 1)
  • Séquençage des bordures intron-exon et des exons non traduits
  • Recherche de délétions par QMPSF (Quantitative Multiplex PCR of Short Fragments)


Exemple : Mutation A 23 V (exon3)

 

Résultats de plus de 10 ans de diagnostic par le Laboratoire SESEP

  • Dans les formes sévères, cette méthode a permis de détecter environ 95 % des mutations.
  • Dans les formes modérées, le taux de détection est difficile à estimer en raison des formes à expression dominante.
  • Plus de 119 nouvelles mutations ont été identifiées (167 sont répertoriées dans la base de données internationale (TNSALP Mutation Database www.sesep.uvsq.fr). Séquençage des bordures intron-exon et des exons non traduits.
  • La forte hétérogénéité allélique rend compte de la forte hétérogénéité clinique.


Quelques unes des mutations du gène ALPL codant pour la TNSALP


Intéret direct du diagnostic pour le patient

  • Le conseil génétique est possible (utile dans les formes sévères ET modérées)
  • Possibilité de diagnostic prénatal
  • Une prise en charge spécifique dans les formes odontologiques est possible
  • Identification des formes dominantes à récurrence plus élevée (50 %) que les formes récessives (25 %)

Intérêt du diagnostic pour la recherche

  • Etudes de corrélations génotype phénotype
  • Etude moléculaire de la dominance
  • Identification des différentes focntions de la TNSALP

 

 

Page réalisée grâce aux données fournies par Etienne MORNET, Brigitte SIMON-BOUDY, Agnès TAILLANDIER, Delphine FAUVERT du Laboratoire SESEP/ Université de Versailles-Saint Quentin en Yvelines

 

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